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有区别。主要区别有，科目分类不同、形态特征不同、生活习性不同，具体如下：
一、科目分类不同
1、变色龙
学名避役，俗称变色龙。属蜥蜴目、避役科、避役属。
2、蜥蜴
学名蜥蜴，俗称四脚蛇、蛇舅母。属蜥蜴目、蜥蜴科、蜥蜴属。
二、形态特征不同
1、变色龙
体长多15～25公分），最长者达60公分。身体长筒状，两侧扁平，头呈三角形，尾常卷曲。眼凸出，两眼可独立地转动。某些种类的头呈盔形，有的种类有显目的头饰，如3个向前方伸出的长角等。
2、蜥蜴
蜥蜴类动物身体一般分为头、颈、躯干、尾4个部分。身体表皮为革质鳞，有些种类在鳞下还有小骨板，牙齿细小，舌的形状、长短随品种而异。眼睛较发达，有些种类还有颅顶眼，除多数壁虎外眼睑多能运动，穴居类型的眼睛多隐于皮下。其耳，鼓膜多显露，鼓膜发达。左右下颔骨以骨缝相联合，因此，口不能张开过大。多数蜥蜴有四肢，但有的只有前肢或后肢，指、趾末端有爪。有胸骨。
三、生活习性不同
1、变色龙
变色龙多出现在雨林至热带大草原，有些则在山区，在寒冷的大草原则很罕见，而且绝对栖息於树上。变色龙最拿手的绝活儿就是变色。它皮肤的基本颜色是绿色,但它可以随时变出深绿、浅绿、紫、蓝、褐色等,甚至可以变出各色相间“花里胡哨”的花纹色。大多数种类是卵生，到地上产卵，卵埋在土里或腐烂的木头里。
2、蜥蜴
蜥蜴生境各异，生活于地下、地表或高大的植被中，沙漠及海岛中均可见。对蜥蜴最为重要的环境因素为温度，许多种有其最适温度，会晒太阳以升高体温，使之高于气温。生活于寒冷地区的种冬眠。昼长对蜥蜴亦有影响。大部分蜥蜴为卵生，卵产于所挖穴中，树木、岩石的裂缝中，或落叶层下。
百度百科-变色龙
百度百科-蜥蜴
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